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Karel Cadoret

 

Étudiante 2è cycle

Département de biochimie, microbiologie et bio-informatique, Université Laval

Pavillon Charles-Eugène-Marchand
1030 avenue de la Médecine
Université Laval
Québec
Québec, Canada
G1V 0A6

5819901916
karel.cadoret@hotmail.com

 

 


 
 
 

Projet de recherche

La diversité virale et les interactions avec les hôtes dans les trous de cryoconites sur la glace surélevée de Ward Hunt

Introduction

Les changements climatiques affectent la région de l’Arctique très rapidement, mais nos connaissances face aux virus nordiques restent très précaires. Par exemple, les écosystèmes uniques des cryoconites de Ward Hunt jouent un rôle non négligeable dans l’accélération de la fonte des glaces, mais les principaux acteurs viraux sont inconnus (McIntyre, 1984). Le temps étant restreignant face aux changements climatiques, il est important de réaliser une étude sur leur diversité dans le but de mieux évaluer leur rôle.

Objectifs

L’objectif principal est de caractériser la diversité virale, l’abondance et les modes d’infections présents dans les cryoconites de Ward Hunt, une région décrite comme étant la zone de dernière glace. Je comparerai les communautés présentes dans les sédiments et dans l’eau de fonte des cryoconites.

Sites d'étude

Le site d’échantillonnage est situé à Ward Hunt (WH), Nunavut, Canada. Plus précisément, les cryoconites échantillonnés se retrouvent sur la glace surélevée (WHIR), où celle-ci s’est formée il y a 1500 ans mer (Braun, Hardy, Bradley, & Sahanatien, 2004). Cette calotte glaciaire est entre 40m et 100m d’épaisseur et est située devant l’île de WH. Entre 2000 et 2002, une fracture dans le plateau de glace, situé autour de l’île WH, a fragilisé la structure de la glace, la rendant encore plus sensible au vent, marées et vagues en plus de drainer le lac épi-plate-forme dans le fjord Disraeli.

Matériel et méthodes

Les sédiments ont été recueillis avec des cuillères en métal stériles et l'eau de fonte a été filtrée directement sur place à travers des filtres Anotops de porosité 0,02 µm. Les acides nucléiques totaux seront extraits et des bibliothèques métagénomiques seront générées à partir de tous les échantillons. Un pipeline bioinformatique personnalisé a été développé pour analyser les données

Références

in cryoconite holes on a high Arctic glacier (Svalbard). Journal of Geophysical Research: Biogeosciences, 112(G4). doi:https://doi.org/10.1029/2006JG000350 Braun, C., Hardy, D. R., Bradley, R. S., & Sahanatien, V. (2004). Surface mass balance of the Ward Hunt Ice Rise and Ward Hunt Ice Shelf, Ellesmere Island, Nunavut, Canada. Journal of Geophysical Research D: Atmospheres, 109(22). doi:10.1029/2004JD004560 Howard-Varona, C., Hargreaves, K. R., Abedon, S. T.,

 
 
Localisation du site de recherche
 
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