Équipe

• Jérôme Comte (demandeur principal, chercheur régulier, INRS)
• Christophe Kinnard (chercheur régulier, UQTR)

Collaborateurs et collaboratrices

• Valentine Cyriaque (membre stagiaire postdoctorale, INRS)

Résumé

Avec l’augmentation des températures, le dégel et l’érosion du pergélisol, entraîne une modification des paysages, dont l’apparition de mares thermokarstiques. Ces transformations ont des impacts sur la connectivité du paysage et de facto, sur la structure et la fonctionnalité des communautés microbiennes des systèmes aquatiques. Les microbes jouant un rôle clef dans les cycles biogéochimiques, ces changements ont des impacts notables sur les émissions de gaz à effet de serre comme le méthane et le dioxyde de carbone. Ce projet combinera la métagénomique et la géomatique pour relier la connectivité hydrologique du paysage et les dynamiques de propagation microbienne. Cette étude comparera les connectivités hydrologiques et microbiennes au sein de pergélisol continu (vallée de Qarlikturvik, Nunavut) et sporadique (vallée de la rivière Sasapimakwananisikw, Nunavik). Il est attendu qu’une dégradation accrue du pergélisol entraine une connectivité hydrologique croissante et un grand partage de la diversité microbienne au sein des mares de thermokarst. La diversité microbienne sera décrite par l’utilisation d’outils génomiques. En particulier, la métagénomique permettra d'évaluer les profils taxonomiques et fonctionnels potentiels des systèmes thermokarstiques, les genres fonctionnels dominants et leurs éléments génétiques mobiles (principaux vecteurs de transferts de gènes au sein et entre systèmes écologiques) ainsi que leur taux de propagation au sein du paysage (connectivité microbienne). La géomatique permettra de lier cette connectivité microbienne à la connectivité hydrologique du paysage via la cartographie d'indices d'humidité des vallées étudiées. Les résultats attendus permettront de mieux comprendre les stratégies adaptatives des communautés microbiennes en réponse au réchauffement climatique et à l’effondrement du pergélisol. Ce projet apportera des réponses cruciales face aux urgences environnementales et sanitaires liées au dégel du pergélisol notamment les risques liés à la dispersion de pathogènes et gènes de résistance aux antibiotiques dans ces environnements en mutation.